水溶液中的硼酸分子会进一步与氢氧根离子结合，产生硼酸根离子（B（OH）4–），其两边的「-OH 基团」可以和食物中的长链状分子中的-OH 基团反应形成键结，担任长链间桥梁的角色，使长链分子们可形成3D 网状结构，这便是硼砂可使食物更为Q 弹的关键。
同样地，硼砂在酸性溶液中，例如硫酸或盐酸，会被酸化为硼酸，但因氢氧根离子浓度低，不会进而生成硼酸根离子。
硼酸的其他应用：消毒、除虫、缓冲液
除了自然帮助植物生长，硼酸在上也有所应用，它具有消毒作用，可以轻微割伤与，也能抑制霉菌的（如或是），常用作敷药或是药膏来使用。稀释过后的硼酸水溶液（允许浓度为3%）则能用作眼或是洗眼液，舒缓眼睛的不适感，也是目前以知道睛有益的酸。
另外，硼酸具有常见害虫的功用（硼砂也有相同效果），主要机制是腐蚀昆虫的外骨骼，并藉由饵食摄入的方式影响其新陈代谢。
硼酸在水中电离时不是失去质子，而是与水中的OH-根结合：H3BO3+2H2O=(H3O+)+B(OH)4-,这与硼化合物缺电子结构特点有关，硼酸中硼原子可作为电子对接受体与一个OH-根结合，OH-根中氧是电子对给予体，硼酸是典型的路易斯酸（什么是路易斯酸？可点击链接：肼（联氨）为什么属于二元弱碱？了解）。所以，硼酸是一元酸。其酸性极弱 (Ka＝ 5.8×10-10)，与硅酸相似 (K1＝2×10-10)。
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